Zmiany wprowadzane do uzp protokołami dodatkowymi wchodzą w życie nie wcześniej niż z dniem zarejestrowania protokołu przez okręgowego inspektora pracy. Jeżeli są to zmiany na korzyść zatrudnionych, to można je stosować z dniem zarejestrowania z mocą wsteczną. Natomiast te na niekorzyść zaczną obowiązywać dopiero po zarejestrowaniu protokołu dodatkowego, a następnie po ich wypowiedzeniu indywidualnie każdemu pracownikowi. Pamiętać też trzeba o art. 241¹³ § 2 k.p. Zgodnie z nim przy wypowiadaniu dotychczasowych warunków umowy o pracę nie stosuje się przepisów ograniczających dopuszczalność dokonywania takich wypowiedzeń. Zatem przy zmianie układu na niekorzyść wszystkim pracownikom (nawet szczególnie chronionym) można wypowiedzieć dotychczasowe warunki zatrudnienia.